Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn7aB1AYL1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms