Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms