Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod3Q9R0E1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms