Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms