Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms