Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hmgn5Q9JL35 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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