Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl1Q9JKV7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Extl1Q9JKV7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms