Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms