Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms