Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc46a3Q9DC26 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms