Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms