Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc105Q9D4K7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc105Q9D4K7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms