Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp2bpQ9D4C6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms