Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spns3Q9D232 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Spns3Q9D232 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms