Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkrip1Q9CWV6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms