Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gkn2Q9CQS6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkn2Q9CQS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms