Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim3Q99PE5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms