Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms