Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms