Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms