Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Rnf144aQ925F3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf144aQ925F3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf144aQ925F3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf144aQ925F3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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