Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spdl1Q923A2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms