Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp4Q8VHC5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp4Q8VHC5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms