Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk4Q8VEJ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms