Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc30Q8BVF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms