Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc4Q8BP86 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc4Q8BP86 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms