Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.6Q85ZW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.6Q85ZW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms