Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil2Q6R2P8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms