Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms