Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.2 ms