Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms