Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxd1Q61345 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms