Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms