Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms