Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms