Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rmdn3Q3UJU9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms