Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms