Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms