Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms