Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Caprin2Q05A80 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms