Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bop1P97452 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms