Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psme1P97371 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme1P97371 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psme1P97371 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psme1P97371 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms