Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox2P48432 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox2P48432 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms