Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf1P46099 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf1P46099 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf1P46099 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms