Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5cP41230 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5cP41230 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5cP41230 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5cP41230 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms