Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acvr1P37172 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms