Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms