Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tacr1P30548 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms