Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpraP18052 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpraP18052 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms