Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms